Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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