Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCEQ02156 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms