Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU5F1Q01860 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms