Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA2P52292 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KPNA2P52292 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms