Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A3P48751 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A3P48751 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms