Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2E1P29083 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2E1P29083 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2E1P29083 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2E1P29083 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2E1P29083 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2E1P29083 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms