Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms