Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGSF3O75054 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms