Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP58Q9Y2X3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms