Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms