Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms