Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms