Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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