Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTD1Q8N815 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms