Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms