Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT28Q7Z3Y7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms