Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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