Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms