Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP73O15350 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP73O15350 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP73O15350 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP73O15350 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP73O15350 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP73O15350 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP73O15350 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TP73O15350 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP73O15350 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP73O15350 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP73O15350 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP73O15350 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP73O15350 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms