Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms