Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms