Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms