Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms