Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHA12Q9UN75 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms