Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB55

CYP3A43, Cytochrome P450 3A43, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A43Q9HB55 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP3A43Q9HB55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP3A43Q9HB55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms