Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms