Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNHG12Q9BXW3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms