Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf48Q96LL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms