Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SIRT1Q96EB6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIRT1Q96EB6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIRT1Q96EB6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms