Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF1Q92879 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF1Q92879 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms