Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP33Q8TEY7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms