Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms