Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLRC3Q5JS37 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms