Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF4Q2M2E3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF4Q2M2E3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms