Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME3Q16798 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME3Q16798 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME3Q16798 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME3Q16798 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME3Q16798 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ME3Q16798 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ME3Q16798 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME3Q16798 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME3Q16798 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME3Q16798 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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