Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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