Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms