Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH6P55285 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH6P55285 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH6P55285 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH6P55285 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH6P55285 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH6P55285 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH6P55285 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH6P55285 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH6P55285 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH6P55285 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH6P55285 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH6P55285 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH6P55285 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH6P55285 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms