Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS1P54277 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS1P54277 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS1P54277 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS1P54277 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS1P54277 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS1P54277 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms