Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB4P28070 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms