Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTNP21246 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTNP21246 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTNP21246 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTNP21246 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTNP21246 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTNP21246 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTNP21246 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTNP21246 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTNP21246 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTNP21246 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTNP21246 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms