Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRAP19793 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RXRAP19793 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRAP19793 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRAP19793 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RXRAP19793 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms