Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KDM4AO75164 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms