Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXN3O00409 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXN3O00409 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms