Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms