Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms