Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BPIFA1Q9NP55 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms