Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN4RQ9BZR6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN4RQ9BZR6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms