Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms