Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 750 ms